TP de systématique bactérienne

Vous trouverez dans cette article un certain nombre de protocole de TP sur la systématique bactérienne.

Démarrons par une introduction à la systématique bactérienne et découvrons les grands groupes bactériens

Objectif :
  • Aperçu général des différents groupes bactériens

Intéressons nous maintenant aux bacilles Gram négatif non exigeants et aérobies

Objectif :
  • Connaissance du groupe des bacilles à Gram négatif : étude des caractères différentiels entre les Enterobacteriaceae, le genre Vibrio et apparentés et le genre Pseudomonas et apparentés.

Les Entérobactéries (1ère partie) : identification bactérienne jusqu’au genre et /ou à l’espèce à l’aide d’une macrogalerie

Objectifs :
  • Mettre en évidence les caractères morphologiques, culturaux et biochimiques pour orienter l’étude vers la famille des entérobactéries.
  • Réaliser l’ensemencement d’une galerie traditionnelle d’identification en tubes (= macrogalerie)
  • A l’aide des tableaux dichotomiques, identifier le genre voire l’espèce de la bactérie donnée.

Les Entérobactéries (2ème partie) : identification bactérienne jusqu’au genre et /ou à l’espèce à l’aide d’une microgalerie

Objectifs :
  • Mettre en évidence les caractères morphologiques, culturaux et biochimiques pour orienter l’étude vers la famille des entérobactéries.
  • Réaliser l’ensemencement d’une galerie miniaturisée d’identification en plaque (= microgalerie)
  • A l’aide des tableaux dichotomiques, d’identification et du catalogue analytique, identifier l’espèce de la bactérie donnée.

Les Entérobactéries (3ème partie) : les Entérobactéries lactose + : l’exemple des coliformes

Objectifs :
  • Mettre en évidence les caractères morphologiques, culturaux et biochimiques pour orienter l’étude vers la famille des entérobactéries.
  • Réaliser l’ensemencement d’une macrogalerie en vue de la détermination de l’espèce du coliforme.
  • A l’aide du tableau dichotomique, identifier l’espèce du coliforme donné.
  • Réaliser, interpréter et conclure un test de Mackensie.

Les Entérobactéries (4ème partie) : les Entérobactéries lactose - : les genres Salmonella et Shigella ainsi que les entérobactéries DA +

Objectifs :
  • Mettre en évidence les caractères morphologiques, culturaux et biochimiques pour orienter l’étude vers la famille des entérobactéries.
  • Réaliser l’ensemencement d’une macrogalerie en vue de la détermination de l’espèce de l’entérobactérie lactose - .
  • A l’aide du tableau dichotomique, identifier l’espèce de l’entérobactérie lactose - .
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Les Entérobactéries (5èmepartie) : le sérotypage de Salmonelles et le test de l’uréase rapide

Objectifs :
  • Reconnaître des colonies suspectes sur milieu sélectif spécifique
  • Mettre en oeuvre un test d’orientation rapide vers le genre Salmonella
  • Identifier la bactérie suspecte suite au résultat de l’uréase rapide par ensemencement d’une galerie réduite
  • Déterminer le sérotype d’une salmonelle identifiée biochimiquement par la technique du sérotypage
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Intéressons nous maintenant aux genres Pseudomonas et apparentés

Objectifs :
  • Exploiter les caractères de différenciation des genres pour orienter l’identification.
  • Identifier l’espèce bactérienne grâce à la galerie biochimique.
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Enfin terminons par l’étude des genres Vibrio et apparentés

Objectifs :
  • Exploiter les caractères de différenciation des genres pour orienter l’identification.
  • Identifier l’espèce bactérienne grâce à la galerie biochimique et au tableau biochimique
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